A fim de firmar convênios, acordos de cooperação técnica, projetos e financiamentos que impliquem na vinculação institucional da Fiocruz com outras entidades, pública ou privada, nacional ou estrangeira, os laboratórios e serviços do Icict negociam / estabelecem parcerias para o desenvolvimento de atividades de cooperação, em consonância com planos, metas, objetivos e atividades estratégicas para a Instituição, o Ministério da Saúde, Ministério da Ciência e Tecnologia e outras áreas do Governo Federal. No último biênio, 36 acordos de cooperação técnica foram firmados com diversas instituições nacionais, por exemplo, para a realizaçao de atividades de pesquisa, ensino, desenvolvimento tecnológico, produção, serviços de referência e informação técnico-científica. E a perspectiva é de crescimento.

O Icict também tem contribuído de forma decisiva para a expansão e consolidação da Rede Brasileira de Bancos de Leite Humano (Rede BLH-BR), por meio de ações estratégicas desenvolvidas em articulação com o Instituto Nacional de Saúde da Mulher, da Criança e do Adolescente Fernandes Figueira (IFF/Fiocruz), que coordena a Rede. Nos últimos dois anos, acordos de cooperação técnica para implantação e qualificação de bancos de leite humano foram firmados com 19 Estados brasileiros. Participam da iniciativa, além do Icict e do IFF, as secretarias estaduais de saúde do Acre, Alagoas, Amapá, Ceará, Distrito Federal, Maranhão, Mato Grosso, Mato Grosso do Sul, Minas Gerais, Pará, Paraná, Piauí, Rio Grande do Norte, Rio Grande do Sul, Rondônia, Roraima, Santa Catarina, Sergipe e Tocantins.