A Biblioteca de Manguinhos é especializada na área de Ciências Médicas e Biológicas, em um acervo construído ao longo de mais de 120 anos de história. Abriga aproximadamente 1 milhão de volumes, além de oferecer acesso a diferentes bases de dados.
Compõe a Rede de Bibliotecas da Fiocruz e atende a profissionais de saúde, alunos de pós-graduação, professores e pesquisadores da Fundação, bem como o público em geral.